Уже с 23 июня 1941 г. в двух крупнейших музеях Ленинграда — Эрмитаже и Русском музее — началась подготовка к эвакуации. Параллельно эта работа развернулась и во дворцах-музеях пригородов — Пушкина, Петергофа, Ораниенбаума и Павловска.
Владельцы ценных библиотек и произведений искусства, отправляясь в эвакуацию и переживая за их сохранность, передавали свои собрания на хранение в музеи. Так Русский музей принял художественные коллекции А. П. Остроумовой-Лебедевой, Н. И. Альтмана и Н. А. Тырсы. В музеи поступали также произведения искусства, приобретённые закупочной комиссией.
Музейные сотрудники организовывали выставки, занимались издательской и научной работой. Так, в 1941 г. в Эрмитаже состоялись научные собрания, посвящённые 800-летию азербайджанского поэта Низами Гянджеви и 500-летию узбекского поэта Алишера Навои.